Como se pode verificar pelo mapa anexo, publicado pela Confederación Hidrográfica del Guadiana, a Bacia Hidrográfica está dividida em três partes, a Baixa, a Média e a Alta, com três parques naturais, o «Parque Natural do Vale do Guadiana», em Portugal, já a caminho da Foz, no Golfo de Cádiz, o «Parque Natural de las Tablas de Daimel», e o «Parque Natural de Las Lagunas de Ruidera», estes perto da nascente.
O rio tem 818 quilómetros de extensão, cruza cinco províncias espanholas e três comunidades autónomas distintas, Castilla-LaMancha, Extremadura, Andalucia, em Espanha, e duas Regiões portuguesas, Alentejo e Algarve.
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